Tá aí uma ótima idéia!
Se você acha que criptografia de dados não é o bastate, vai se interessar por esse produto.

Estou falando do USB Flash Drive Lock que se encaixa no pen drive como uma porta USB mesmo.

Caso você perder seu pen drive e ele esteja protegido, quem achar não vai conseguir usá-lo.

Se um burro ignorante encontrá-lo ele optará por pegar uma marreta e descer nele sem nenhuma compaixão até seu "pendrivizinho" virar varelo.
Se for um kra "cabeça" o coitadinho pode tenhar descobrir a senha , arriscando 999 tentativas, uma vez que um cadeado pra senhas de 3 dígitos.

O USB Flash Drive Lock está à venda no Reino Unido por cerca de 18 reais a unidade, ou você pode levar o par por R$ 29. É o preço da segurança.